১৯৯৩ সাল পর্যন্ত শিক্ষা মন্ত্রণালয়ের উপজেলা পর্যায়ে কোন অফিস ছিল না। কিন্তু মাধ্যমিক শিক্ষার গুনগতমান উন্নয়ন, একাডেমিক সুপারভিশন, প্রশাসনিক ও আর্থিক স্বচ্ছতা নিশ্চিত করার জন্য উপজেলা পর্যায়ে অফিস স্থাপনের প্রয়োজনীয়তা দেখা দেয়। সে কারনে শিক্ষামন্ত্রণালয় ১৯৯৩সালে ৪ টি প্রকল্পের মাধ্যমে জাতীয় ভিত্তিক উপবৃত্তি কার্যক্রমের মাধ্যমে প্রথমে উপজেলা প্রকল্প কার্যালয় স্থাপন করে । এই প্রকল্প সমূহের দলিলে প্রভিশন রাখা হয় যে , প্রকল্পের মেয়াদ শেষে জনবল রাজস্ব খাতে স্তানান্তর করে উপজেলা মাধ্যমিক শিক্ষা অফিস স্থাপন করা হবে । সে অনুযায়ী ২০০১ সালে প্রকল্পের মেয়াদ শেষে উপজেলা মাধ্যমিক শিক্ষা অফিস প্রতিষ্ঠা করা হয় । এটি এখন শিক্ষা মন্ত্রণালয়ের তৃণমূল পর্যায়ের প্রশাসনিক ইউনিট । শিক্ষামন্ত্রণালয়ের আধিনস্ত সকল দপ্তর, অধিদপ্তরের কার্যক্রম মাঠ পর্যায়ের এই অফিসের মাধ্যমে বাস্তবায়ন হয়ে থাকে । বাংলাদেশের সকল উপজেলায় মাধ্যমিক শিক্ষা অফিসের কার্যক্রম চালু আছে।
খুলনা - ঢাকা মহাসড়কের খুলনা থেকে ১১ কিঃমিঃ দূরে দৌলতপুর /১২ কিঃ মিঃ দূরে রেলিগেট নামক স্থান থেকে কিছুদুর পায়ে হেটে নৌকায় নদী পার হয়ে ভানে ১.৫ / ২ কিঃ মিঃ দিঘলিয়া উপজেলা পরিষদ । উপজেলা পরিষদের ভিতর সুন্দর ও মনোরম পরিবেশে উপজেলা মাধ্যমিক শিক্ষা অফিসটি অবস্থিত।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস